Journal: Bio-Algorithms and Med-Systems

Volume 10, Issue 4

167 -- 168Jacques Chomilier. Some insights into the transition state ensemble of the folding of globular proteins
169 -- 193Tomer Orevi, Gil Rahamim, Sivan Shemesh, Eldad Ben Ishay, Dan Amir, Elisha Haas. Fast closure of long loops at the initiation of the folding transition of globular proteins studied by time-resolved FRET-based methods
195 -- 212Jaume Bonet, András Fiser, Baldo Oliva, Narcis Fernandez-Fuentes. Smotifs as structural local descriptors of supersecondary elements: classification, completeness and applications
213 -- 225Martin Mann, Rolf Backofen. Exact methods for lattice protein models
227 -- 242Ruben Acuña, Zoé Lacroix, Nikolaos Papandreou, Jacques Chomilier. Protein intrachain contact prediction with most interacting residues (MIR)
243 -- 254Stuart J. Tetchner, Tomasz Kosciolek, David T. Jones. Opportunities and limitations in applying coevolution-derived contacts to protein structure prediction

Volume 10, Issue 3

101 -- 115Monika Piwowar, Jacek Dygut, Piotr Piwowar, Leszek Konieczny, Irena Roterman. Attempt at a systemic outlook on aging and carcinogenesis
117 -- 127Leonor Cruzeiro. A kinetic mechanism for in vivo protein folding
129 -- 137Bartosz Glowacz, Mateusz Suchanek, Zbigniew Olejniczak. Production of laser-polarized 3He gas via metastability exchange optical pumping for magnetic resonance imaging
139 -- 149Klaudia Stangel-Wójcikiewicz, Antoni Basta, Monika Piwowar, Maciej Petko, Grzegorz Karpiel, Daria Panek, Inga Ludwin, Robert Jach. Operative procedures supported with robotics systems and available endoscope procedures in operative gynecology
151 -- 157Klaudia Stangel-Wójcikiewicz, Monika Piwowar, Malgorzata Migdal, Krzysztof Skotniczny. Virtual patient case: study of a urinary incontinence therapy procedure in a woman
159 -- 165Jacek Dygut, Sylwia Plonka, Irena Roterman-Konieczna. Involvement of medical experts in legal proceedings: an e-learning approach

Volume 10, Issue 2

53 -- 58Wojciech Wislicki, Tomasz Bednarski, Piotr Bialas, Eryk Czerwinski, Lukasz Kaplon, Andrzej Kochanowski, Grzegorz Korcyl, Jakub Kowal, Pawel Kowalski, Tomasz Kozik, Wojciech Krzemien, Marcin Molenda, Pawel Moskal, Szymon Niedzwiecki, Marek Palka, Monika Pawlik-Niedzwiecka, Lech Raczynski, Zbigniew Rudy, Piotr Salabura, Neha Gupta-Sharma, Michal Silarski, Artur Slomski, Jerzy Smyrski, Adam Strzelecki, Anna Wieczorek, Marcin Zielinski, Natalia Zon. Computing support for advanced medical data analysis and imaging
59 -- 63Jerzy Smyrski, Pawel Moskal, Tomasz Bednarski, Piotr Bialas, Eryk Czerwinski, Lukasz Kaplon, Andrzej Kochanowski, Grzegorz Korcyl, Jakub Kowal, Pawel Kowalski, Tomasz Kozik, Wojciech Krzemien, Marcin Molenda, Szymon Niedzwiecki, Marek Palka, Monika Pawlik-Niedzwiecka, Lech Raczynski, Zbigniew Rudy, Piotr Salabura, Neha Gupta-Sharma, Michal Silarski, Artur Slomski, Adam Strzelecki, Wojciech Wislicki, Marcin Zielinski, Natalia Zon. Application of WLS strips for position determination in strip PET tomograph based on plastic scintillators
65 -- 70Weronika Wolszczak. Depth of interaction determination with temperature gradient function in continuous bismuth germanate oxide (BGO) crystal
71 -- 77Konrad Szymanski, Pawel Moskal, Tomasz Bednarski, Piotr Bialas, Eryk Czerwinski, Krzysztosz Giergiel, Lukasz Kaplon, Andrzej Kochanowski, Grzegorz Korcyl, Jakub Kowal, Pawel Kowalski, Tomasz Kozik, Wojciech Krzemien, Marcin Molenda, Ines Moskal, Szymon Niedzwiecki, Marek Palka, Monika Pawlik-Niedzwiecka, Lech Raczynski, Zbigniew Rudy, Piotr Salabura, Neha Gupta-Sharma, Michal Silarski, Artur Slomski, Jerzy Smyrski, Adam Strzelecki, Piotr Witkowski, Wojciech Wislicki, Marcin Zielinski, Natalia Zon. Simulations of γ quanta scattering in a single module of the J-PET detector
79 -- 83Eryk Czerwinski, Marcin Zielinski, Tomasz Bednarski, Piotr Bialas, Lukasz Kaplon, Andrzej Kochanowski, Grzegorz Korcyl, Jakub Kowal, Pawel Kowalski, Tomasz Kozik, Wojciech Krzemien, Ewelina Kubicz, Marcin Molenda, Pawel Moskal, Szymon Niedzwiecki, Marek Palka, Monika Pawlik-Niedzwiecka, Lech Raczynski, Zbigniew Rudy, Piotr Salabura, Neha Gupta-Sharma, Michal Silarski, Artur Slomski, Jerzy Smyrski, Adam Strzelecki, Anna Wieczorek, Wojciech Wislicki, Natalia Zon. Database and data structure for the novel TOF-PET detector developed for the J-PET project
85 -- 90Pawel Kowalski, Lech Raczynski, Tomasz Bednarski, Piotr Bialas, Eryk Czerwinski, Krzysztof Giergiel, Lukasz Kaplon, Andrzej Kochanowski, Grzegorz Korcyl, Jakub Kowal, Tomasz Kozik, Wojciech Krzemien, Marcin Molenda, Ines Moskal, Pawel Moskal, Szymon Niedzwiecki, Marek Palka, Monika Pawlik-Niedzwiecka, Zbigniew Rudy, Piotr Salabura, Neha Gupta-Sharma, Michal Silarski, Artur Slomski, Jerzy Smyrski, Adam Strzelecki, Konrad Szymanski, Wojciech Wislicki, Piotr Witkowski, Marcin Zielinski, Natalia Zon. Determination of the map of efficiency of the Jagiellonian Positron Emission Tomograph (J-PET) detector with the GATE package
91 -- 99Kinga Salapa, Agata Trawinska, Irena Roterman, Ryszard Tadeusiewicz. Speaker identification based on artificial neural networks. Case study: the Polish vowel (pilot study)

Volume 10, Issue 1

1 -- 7Artur Slomski, Zbigniew Rudy, Tomasz Bednarski, Piotr Bialas, Eryk Czerwinski, Lukasz Kaplon, Andrzej Kochanowski, Grzegorz Korcyl, Jakub Kowal, Pawel Kowalski, Tomasz Kozik, Wojciech Krzemien, Marcin Molenda, Pawel Moskal, Szymon Niedzwiecki, Marek Palka, Monika Pawlik, Lech Raczynski, Piotr Salabura, Neha Gupta-Sharma, Michal Silarski, Jerzy Smyrski, Adam Strzelecki, Wojciech Wislicki, Marcin Zielinski, Natalia Zon. 3D PET image reconstruction based on the maximum likelihood estimation method (MLEM) algorithm
9 -- 12Piotr Bialas, Jakub Kowal, Adam Strzelecki, Tomasz Bednarski, Eryk Czerwinski, Krzysztof Giergiel, Lukasz Kaplon, Andrzej Kochanowski, Grzegorz Korcyl, Pawel Kowalski, Tomasz Kozik, Wojciech Krzemien, Marcin Molenda, Ines Moskal, Pawel Moskal, Szymon Niedzwiecki, Marek Palka, Monika Pawlik, Lech Raczynski, Zbigniew Rudy, Piotr Salabura, Neha Gupta-Sharma, Michal Silarski, Artur Slomski, Jerzy Smyrski, Konrad Szymanski, Wojciech Wislicki, Piotr Witkowski, Marcin Zielinski, Natalia Zon. List-mode reconstruction in 2D strip PET
13 -- 17Tomasz Bednarski, Eryk Czerwinski, Pawel Moskal, Piotr Bialas, Krzysztof Giergiel, Lukasz Kaplon, Andrzej Kochanowski, Grzegorz Korcyl, Jakub Kowal, Pawel Kowalski, Tomasz Kozik, Wojciech Krzemien, Marcin Molenda, Ines Moskal, Szymon Niedzwiecki, Marek Palka, Monika Pawlik, Lech Raczynski, Zbigniew Rudy, Piotr Salabura, Neha Gupta-Sharma, Michal Silarski, Artur Slomski, Jerzy Smyrski, Adam Strzelecki, Konrad Jan Szymanski, Wojciech Wislicki, Piotr Witkowski, Marcin Zielinski, Natalia Zon. Calibration of photomultipliers gain used in the J-PET detector
19 -- 25Michal Silarski, Eryk Czerwinski, Tomasz Bednarski, Pawel Moskal, Piotr Bialas, Lukasz Kaplon, Andrzej Kochanowski, Grzegorz Korcyl, Jakub Kowal, Pawel Kowalski, Tomasz Kozik, Wojciech Krzemien, Marcin Molenda, Szymon Niedzwiecki, Marek Palka, Monika Pawlik, Lech Raczynski, Zbigniew Rudy, Piotr Salabura, Neha Gupta-Sharma, Artur Slomski, Jerzy Smyrski, Adam Strzelecki, Wojciech Wislicki, Marcin Zielinski, Natalia Zon. A novel method for calibration and monitoring of time synchronization of TOF-PET scanners by means of cosmic rays
27 -- 31Lukasz Kaplon, Andrzej Kochanowski, Marcin Molenda, Pawel Moskal, Anna Wieczorek, Tomasz Bednarski, Piotr Bialas, Eryk Czerwinski, Grzegorz Korcyl, Jakub Kowal, Pawel Kowalski, Tomasz Kozik, Wojciech Krzemien, Szymon Niedzwiecki, Marek Palka, Monika Pawlik, Lech Raczynski, Zbigniew Rudy, Piotr Salabura, Neha Gupta-Sharma, Michal Silarski, Artur Slomski, Jerzy Smyrski, Adam Strzelecki, Wojciech Wislicki, Marcin Zielinski, Natalia Zon. Plastic scintillators for positron emission tomography obtained by the bulk polymerization method
33 -- 36Wojciech Krzemien, Michal Silarski, Karol Stola, Damian Trybek, Tomasz Bednarski, Piotr Bialas, Eryk Czerwinski, Lukasz Kaplon, Andrzej Kochanowski, Grzegorz Korcyl, Jakub Kowal, Pawel Kowalski, Tomasz Kozik, Marcin Molenda, Pawel Moskal, Szymon Niedzwiecki, Marek Palka, Monika Pawlik, Lech Raczynski, Zbigniew Rudy, Piotr Salabura, Neha Gupta-Sharma, Artur Slomski, Jerzy Smyrski, Adam Strzelecki, Wojciech Wislicki, Marcin Zielinski, Natalia Zon. J-PET analysis framework for the prototype TOF-PET detector
37 -- 40Grzegorz Korcyl, Pawel Moskal, Tomasz Bednarski, Piotr Bialas, Eryk Czerwinski, Lukasz Kaplon, Andrzej Kochanowski, Jakub Kowal, Pawel Kowalski, Tomasz Kozik, Wojciech Krzemien, Marcin Molenda, Szymon Niedzwiecki, Marek Palka, Monika Pawlik, Lech Raczynski, Zbigniew Rudy, Piotr Salabura, Neha Gupta-Sharma, Michal Silarski, Artur Slomski, Jerzy Smyrski, Adam Strzelecki, Wojciech Wislicki, Marcin Zielinski, Natalia Zon. Trigger-less and reconfigurable data acquisition system for positron emission tomography
41 -- 45Marek Palka, Pawel Moskal, Tomasz Bednarski, Piotr Bialas, Eryk Czerwinski, Lukasz Kaplon, Andrzej Kochanowski, Grzegorz Korcyl, Jakub Kowal, Pawel Kowalski, Tomasz Kozik, Wojciech Krzemien, Marcin Molenda, Szymon Niedzwiecki, Monika Pawlik, Lech Raczynski, Zbigniew Rudy, Piotr Salabura, Neha Gupta-Sharma, Michal Silarski, Artur Slomski, Jerzy Smyrski, Adam Strzelecki, Wojciech Wislicki, Marcin Zielinski, Natalia Zon. A novel method based solely on field programmable gate array (FPGA) units enabling measurement of time and charge of analog signals in positron emission tomography (PET)
47 -- 52Malgorzata Trofimiuk-Müldner, Alicja Hubalewska-Dydejczyk. Positron emission tomography (PET) in oncology: current applications and future perspectives